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物流公司车辆取得高速公路通行费的进项税计算原则主要有两类： 一是根据高速公路通行费的具体情况，可以按照相关规定对取得的费用采取不同的税计算方法； 二是物流公司需要在企业所得税税务登记时向税务机关申报，申报高速公路通行费，并根据实际情况，计算税负，直接缴纳税款。 但无论采用哪一种计算方法，一定要按照有关法规和要求，做好申报和缴纳工作，保证申报准确，不要违反法律法规，保证纳税义务的正常履行。 拓展知识： 税负的计算方法有计算法、加计抵减法和定额扣除法。计算法无论是高速公路通行费还是其他取得的费用，都需按照实际发生额的3%的税率缴纳。加计抵减法是指对取得的费用，可以适用税类抵减申报，缴纳应纳税额。而定额扣除法则是指无论取得的费用多少，都可以按照定额扣除法报税，减少申报金额，从而减免税款。