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应交增值税科目的余额需要用于留抵退税申报。具体来说，就是按照《企业所得税实施条例》的规定，一般纳税人在准备报税时，需要在报税期内，将在当期应交增值税科目的余额中的"本期可留抵退税额"填到报税表中。申报时，企业可以将当期可留抵税额填到税表中，由税务部门进行核定，若核定结果为合法，即可用于留抵退税。 拓展知识：根据《企业所得税法》，企业在留抵退税申报时，还需要提供进项税额科目的余额的相关凭证，以证明企业当期的进项税额已经计提并缴纳，方可申报退税。