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是的，需要在主表填写。根据《中华人民共和国增值税税收暂行条例》的规定，纳税人申报增值税，应当按照《增值税综合申报表》的要求填报相应的核定表格，并体现在增值税综合申报表的主表中。因此，增值税税控抵减后的情况也应当填报到主表中，以便政府部门对纳税人的增值税申报情况进行监督。 拓展知识：纳税人申报增值税时，应根据国家有关规定和税务机关的要求，操作税控申报终端，根据实际缴纳的应纳税额确定本季度的税款，填报《增值税综合申报表》的主表和附表，并在指定的申报时间内报给税务机关。