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老师你好， 根据《中华人民共和国个人所得税法》第八条规定，职工所得按劳务报酬所得计算，由用人单位按照月度缴纳个人所得税。 因此，甲方直接拨付给农民工的工资，施工单位应按照相关规定向税务机关申报缴纳个人所得税。 具体缴纳流程如下： （1）用人单位应按照月度向税务机关申报收入所得情况，并准备相关报表。 （2）用人单位应按照税务机关规定的标准缴纳个人所得税。 （3）税务机关对报表和缴纳情况进行核实，确认缴纳情况是否按照有关规定执行。 （4）用人单位按照有关规定提出申报资料，并在规定期限内交纳个人所得税。 拓展知识 税务机关同时也会对纳税单位工资发放情况进行审核，以确保单位是否依照有关规定支付工资，避免不正当支付的情况发生。此外，税务机关也会定期检查单位是否按期缴纳个人所得税，进行查处和处罚。