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是的，异地建安工程项目预缴纳的增值税可以在总部申报增值税纳税申报表时扣除。 一般来说，异地项目纳税人应当对其在投资开发的异地工程项目的有关税款，按照法定税率缴纳增值税，在所在地取得增值税专用发票后，在总部进行跨地区增值税调整抵扣。 在申报增值税时，需要注意几个方面：一是要准确填写“一般纳税人跨地区差额抵扣明细表”，二是要妥善保管纳税信息，包括缴纳增值税及其他税费的各项证明材料，以备异地税务机关审查。 拓展知识：在减免增值税时，可以把多个税种的税金的减免综合起来抵扣，并可以在多年内抵扣，但需要遵守《企业所得税减免税政策实施细则》中规定的相关减免规则。