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一般来说，合作社从个人收购的苗木开免税发票是不行的。因为部分政府机关会要求合作社需要提供个人缴纳过税的证明，而合作社收购的苗木恐怕是个人未缴税的，所以合作社不能发票。 此外，由于合作社所销售的苗木来自个人，若要开出免税发票，就可能会是一种违反税务法规的行为。因为发出免税发票存在漏税等问题，因此合作社就不能发出这样的发票。 但是，合作社也可以开出普票，但前提是提供相关账单等发票材料，以便个人报税申报。另外，合作社还可以在购买之前与个人协商，由个人把苗木进行税务申报，合作社把税已经缴纳的发票材料拿回，并向客户开具发票。这样可以有效避免发生漏税行为，也避免合作社开免税发票。 拓展知识：要想缴纳税款，就需要对发票进行认证，这将会使用到发票认证系统。发票认证系统是指发票自动核查的系统，它可以检测和识别发票上的信息，并将其存储在数据库中。发票认证系统可以有效地防止伪造发票等不当行为，进而有效控制税收。