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首先，要分别为专项经费和自筹经费建立各自的账户。然后，当需要支出时，要首先从收入中核实是否有相应的收入可以抵消之前的支出。当发生发票或其他形式的支出时，财务人员需要同时记录在专项经费和自筹经费的对应账户中，使得每一笔支出及收入都能合理分配到专项经费和自筹经费的账户中，便于核算两种经费的使用情况。除此之外，财务系统也需要定期进行统计核算，以确保财务成本的及时更新，以便及时发现财务异常、及时做出有效的决策，最终达到合理规划、及时回报的财务目标。 拓展知识：专项经费是政府或企业拨出的特定用途、有限金额的收支，通常用于购买特定设备、支付特定服务费用或拨付福利费用，而自筹经费则是源自企业自身的经营活动，比如积累的盈利或外来投资等。如果不进行专业的财务管理，专项经费和自筹经费容易出现模糊混淆、难以界定用途，严重影响企业财务和经营状况，因此，需要及时有效地管理和核算。