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对于公司收到投资款100万的情况，公司应首先做的事情是把收到的投资款记录在账上，也就是在现金流量表上增加100万的收入，此外，公司应根据投资人持股比例，增加100万的负债，去购买对方公司股份。在此过程中，应该注意确认公司是否应该交印花税，因为根据《国家税务总局关于印花税税务管理有关问题的通知》，一般投资领取股息、收购股份等行为均属于应纳税事项，因此，公司收到投资款100万也有可能需要缴纳印花税，具体的税率根据不同的地方法律法规有所不同。拓展知识：要想免征税，需要符合《企业所得税法》第三十三条的规定，即可以由扣除核定的股权投资收益的所得减少才得税的企业所得税税额。