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预缴增值税按照开票金额预缴。按照上海市税务局的规定，企业在开具货物发票时应当按照发票金额预缴增值税。因此，根据《上海市营业税收定税率办法》第六条的规定，我们可以知道预缴是按照开票金额预缴。 此外，根据《中华人民共和国征收管理法》第22条的规定，预缴也可以按照汇总计算或销售价格的进项税额比例预缴。因此，根据汇总计算的税额比例和合同金额，企业也可以按照合同金额预缴增值税。 拓展知识：增值税预缴是指企业在形成应税事件，也就是在销售货物或者提供劳务之前，提前缴纳增值税的行为。预缴增值税是一种非常有效的实施税收政策，能够更好地合理分配企业税务负担、促进企业财务管理合规化和规范，促进企业合法经营。