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根据国家税务总局发布的《税控技术规范》，非独立核算的分支机构购买的税控盘，取得分支机构抬头的电子普通发票，是可以全额抵扣进项的，具体申报程序是：总公司把此发票上传至国家税务总局网上报税系统，再由税务总局向国家发票管理中心（FPM）申报认证，获得认证后，即可将从分支机构购买的此发票全额抵扣进项，因为分支机构的发票可以和总公司的发票统一到国家税务总局税控系统，可以控制发票认证通过时，总公司可以进行抵扣。 另外，增值税专用发票也需要通过上述认证流程才可以进行进项税抵扣，因为增值税专用发票是专门用于企业之间进行交易用的，不能够用于消费者之间的交易，所以必须要进行认证，以确保安全使用。拓展知识：目前，增值税专用发票开具的税率逐渐改为16%，从而更好的符合企业之间的销售行为。