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小型微利企业应当缴纳的企业所得税是根据《企业所得税法》的规定来确定的。根据目前的规定，小型微利企业的企业所得税税率为20%，但实际应缴税款为50万×20%=10万元，该税款可以在税务部门的网上缴纳平台上直接缴纳，也可以由企业指定的会计事务所进行缴纳，以确保企业合规缴税。 拓展知识：企业应缴税款，按照《企业所得税法》的规定，在每个税款期限内必须按时向税务机关缴纳税款。企业应当按期申报纳税信息，及时更新税务机关的企业信息，以及定期进行税收专项审计，以确保企业的正确缴纳税款。