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是的，报关单和进项发票可以开在一起申报退税，这是一种合理的申报方式。具体来说，报关单和进项发票可以独立申报：首先，报关单需要重新填写，报关单上的发票号要等于进项发票号，其次，报关单需要将进项发票和报关单全部上传，最后，通过报关单可以获取进项发票号，以及对应发票税率，最后这两个发票可以统一申报。 另外，有些情况下，进项发票会因为各种原因，无法和报关单合并申报，这种时候，可以通过增值税普报来申报，这种情况下，进项发票的纳税起始月份，状态为暂停，待报关单申报完成，可以将进项发票启动，以便统一申报。 总的来说，报关单和进项发票可以合并申报退税，但也要灵活应对特殊情况，通过增值税普报来申报。