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分公司独立核算，自负盈亏，企业所得税的处理原则在于，如果分公司是独立核算且自负盈亏的，则由各分公司负责申报和缴纳企业所得税，不需要并到总公司。企业所得税是企业增值时应缴纳的税费，属于利润性收入，企业纳税按照法定税率计算并缴纳，税务部门会核实分支和总公司的企业所得税的报表，如果发现分公司未报税，则总公司需要为之代缴。当然，有些情况下，总公司可以按照税务部门要求，为分公司提供集团服务，完成总公司纳税申报报表。此时，企业所得税是由总公司缴纳。 拓展知识：业内普遍公认的总公司与分公司纳税关系及企业所得税缴纳原则是，总公司按照集团服务费用报销要求，把服务费用记录在各分公司的账目成本中，然后分公司在申报企业所得税的时候，减去相应的服务费用，总公司实现了“不纳税，也不让税”的效果。