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对于苗木公司的主营业务来说，苗木销售是免税的，而房租租金收入则不一定，这要取决于房租租金收入使用的目的。根据《财政部 财政税务总局 国家税务总局关于开征增值税税控系统计算机信息记录仪发票收支结算软件及销售软件试点有关事项的公告》，开发房租金发票需缴纳增值税，税率为6%。如果是非居民企业，则需缴纳6%的增值税，并且办理纳税人资格，申报年度纳税申报。此外，增值税规定2022年开始，苗木销售是免税的，如果有房租金收入，依旧需缴纳6%的增值税。 对于苗木公司而言，应了解各种实施的税收政策，加强对纳税申报、收入支付及收支结算的管理，以合理缴纳增值税和使用房租金收入。特别是要关注增值税的变化，及时更新自身的税务知识。另外，苗木公司也可以合理安排自己的收入，将部分收入转入自己的其他非房租租金收入，减少支付税收的负担。