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土地增值税汇算清缴一般是按照土地征收面积算的。以下是汇算清缴主要流程： 1、首先，根据规定标准前往落实土地征收，申请土地使用权获取其他可使用的证明文件。 2、在取得土地使用权后，房地产开发公司自行计算土地面积，也可向土地行政主管部门邀请公证人员参与确认。 3、按照土地征收面积申报缴纳土地增值税，涉及到税收管理，一般会有土地税务机关协助落实。 4、最后，申报清算出口增值税，这时，可核实入口增值税及其他税费，做汇算清缴。 以上是房地产开发公司土地增值税汇算清缴的流程。在这个过程中，土地面积一定要按照土地征收面积来算，而不是按照土地出让合同面积来算。 拓展知识：土地增值税的计算，其实已经有一个标准的计算公式，即：土地增值税=(增值额/出让面积)*(土地出让价格-土地剩余价格)*税率，其中增值额是指出让面积内发生土地使用权变更后土地出让价格总差额，也就是说土地出让面积内的土地出让价格和土地剩余价格的差额。