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增值税普通发票和专用发票在增值税税率及税额计算上是有一定差异的，普通发票是按销售额乘以税率计算税额，而专用发票是按照总额乘以税率计算税额。以上述情况举例，当普通票1000元开具时，销售额应为1000元，增值税税率为3%，税额为30元。而专用票同样1000元开具，总额应为1030元，增值税税率依旧为3%，税额为30.9元。因此，1000元的普通发票和专用发票之间在实际付费差异上，应为0.9元。 拓展知识：计算增值税时，纳税人应当使用普通发票，按照销售额计税；非纳税人则可使用普通发票或专用发票，而具体选择普通发票还是专用发票，可根据其本身的实际情况选择，以达到节税的目的。