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是的，您可以把运费4万元抵扣，根据《中华人民共和国企业所得税暂行条例》第六十三条的规定，可以把购进货物所支付的运费作为企业所得税的费用抵扣。抵扣前提是普通发票开具、符合实际发生的原则，并根据国家规定缴纳应税款。 拓展知识： 《中华人民共和国企业所得税暂行条例》第六十五条的规定，企业可以把所取得的差旅费，如差旅费、通讯费、招待费及实施研究发展活动的费用，作为企业所得税的费用抵扣。但以上这些费用必须使用普通发票开具，并符合实际发生的原则，并根据国家规定缴纳应税款。