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将1万的留抵退税进项税退回公司账户上时，可以通过如下两种方法来做账： 一、进入银行系统，在支票系统中填写支票给供应商，公司账户上扣除1万支出，同时增加1万的收入，以及“税款返还”的备注。 二、在公司账户上创建一个“税收返还”的科目，登记对应的1万收入，同时用“供应商款项”的科目凭证转入1万支出，以此记录该笔进项税的返还记录。 此外，税务部门会对此笔退税的账务处理过程做跟踪，所以为了保证账务的准确性，公司应当严格按照税务部门的要求和规定进行账务处理。同时，公司应当严格把控公司账务处理的流程，并将每一步的账务处理信息进行记录，以便支撑账务处理的准确性。 拓展知识：收到进项税退款的公司必须注意税务的备案和审核，否则会有违反税务的风险，在最终收到退款之后，最好将退款过程中的所有账务处理记录提交给税务部门进行备案和审核，以确保账务处理的合法性和合规性。