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总分机构和非总分机构的区别主要是出税的范围不同。非总分机构是指仅涉及于持有纳税人在其所在地注册的营业税，而总分机构就比较宽泛，涉及到多个省，可以根据跨省经营情况来报税。 总分机构有一定的优势，比如减少报税义务人数，避免多处报税，还可以节省税务填报时间，还可以有效维护企业的财务安全，以及跨省贸易的税收管理。 但是，注册总分机构需要纳税人满足一定的条件，比如常设机构必须有特定的位置，同时应遵守税务机关的要求，申请总分机构也需要缴纳一定的费用。 在选择总分机构还是非总分机构时，纳税人可以根据自己的实际情况来选择，灵活多变。例如，如果纳税人经营范围较为狭窄，就选择非总分机构；而如果经营范围较大，建议选择总分机构。 拓展知识：除了支付税款这一报税原则外，跨省经营的机构还有跨省税收优惠政策可以享受，比如住房空置税等，纳税人可以根据自身实际情况，向当地税务机关咨询适合自己的优惠政策并作出决定。