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您好，根据您的描述情况，您的总包公司和分包公司是在不同地方，您的总包是在汕头，分包公司是在深圳，若是分包公司的纳税人资质是一般纳税人，则该公司发给总包公司的发票应该开具增值税专用发票，税率为3%，此外，由于您的分包公司是在深圳，您的总包公司应该根据深圳市税政规定确定是否适用分包预缴，并在向分包公司开具发票时将预缴税额一并开具，您的总包公司是在汕头，因此，您的总包公司应当根据汕头市税政规定了解是否适用分包预缴，如果不适用，则不需要预缴税款。拓展知识：分包预缴是由总包公司预收分包公司的税款后代为分包公司向国家税务部门申报缴纳的一种缴税方式，最大的优势在于能大大减少分包企业的财务负担，但也需要注意，分包预缴一般不能单独使用，必须跟总包公司一起进行使用，这样才有利于企业节税。