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根据税务部门关于纳税的相关法律法规，个体工商户收入61,000多元和成本5万元，盈利1万多元的情况下，是需要缴纳税款的。根据《个体工商户纳税证明申报办法》，个体户应当查验它的收入和费用，然后根据个人所得税法的规定申报并缴纳个人所得税。截至2021年2月1日，根据《个人所得税法》，个人所得税的税率为3%至45%，具体分档纳税情况请参考新税法明确规定。 此外，除了缴纳增值税和个人所得税之外，个体户还应当缴纳印花税，以及专项附加税等。根据《印花税法》，个体户应当缴纳税款至国家专项报税机构，具体税款金额应当按照税法规定缴纳。另外，根据《专项附加税法》，个体户将需要缴纳地方教育费附加税和城市维护建设税，具体金额也应当按照法律法规缴纳。 总之，根据相关税务部门的法律法规，个体户收入61,000多元和成本5万元，盈利1万多元的情况下，是需要缴纳税款的，应当按照个人所得税法确定纳税档次，以及缴纳相关印花税和专项附加税等。