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一般纳税人和个体水利基金专项收入的计税依据是不同的。一般纳税人的收入属于非正常收入，这类收入按照居民个人所得税法相关规定计税。而个体水利基金专项收入属于正常收入，因此按照企业所得税法相关规定计税。此外，个体水利基金专项收入还有一定的税收优惠政策，例如可以在一定条件下享受减税政策等。 拓展知识：个体水利基金的税收优惠政策里，如增值税小规模纳税人可以享受收入减半税收优惠等，消费税也可以有一定的减免政策。同时，个体水利基金的投资资金还可以利用类似股息收入减免优惠等多种税收减免方法，来获取更多的税收优惠。