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根据《中华人民共和国个人所得税法实施条例》（税务总局令第45号）第六十九条规定：单位实行工资奖金制度的，应当按照有关规定，由单位扣缴职工个人所得税，并由单位向税务机关申报、缴纳。因此，单位代收到职工申请的住房补贴后应当扣缴职工个人所得税，并向税务机关申报、缴纳。 拓展知识：在收入所得税中，职工除了要缴纳劳动报酬所得，还包括其他一些奖金和补贴，如奖励性费用、补贴，补助等都属于职工收入所得，需要个人所得税。 此外，单位在扣缴个人所得税时，除了要将职工应纳税所得额减去优惠额外，还要加上工资薪金的差额，也就是未扣缴的部分，并同时将两部分加起来扣缴，这部分职工在报税时需要提供凭证。