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如果公司从农户那里直接购买的蔬菜，但农户没有发票，那么公司可以就此事情向税务机关索取证明材料。具体索取的材料包括农户的身份证明，农作物的来源证明，农户的出货清单等。此外，还可以在购买蔬菜时，签订购销合同，由买卖双方签署，书面证明确认购买农作物的事实，以及详细说明购销双方的履行义务、支付货款等情况。最后，公司可以准备有关材料，在缴纳税款时，向税务机关提交相应的书面申报材料，以及按要求报送纳税凭证和付款凭证等，以证明购买蔬菜的事实。 从上述可以看出，税法规定的纳税义务的负担，可以采取有效的凭证制度，以确保纳税义务的完整和准确。拓展知识：税收凭证是指纳税人出具的，用于证明纳税事项及纳税义务已经履行完毕的税收凭据。它是纳税人计算税款、申报纳税、执行国家税收法律和法规的重要依据。