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小规模纳税人第二季度开普票100多万，增值税申报时免税，即按照有关规定，申报纳税人以开具的普通发票作为证据的，且税款金额低于增值税定额抵扣标准的，不再申报计算缴纳增值税，以减少纳税人负担。规定中，增值税定额抵扣标准一般按照月度计算，进项税额未超过30000元，则减免增值税，若超出，则按照50%加计抵扣。另外，小规模纳税人还可以申请抵扣增值税进项税额，根据税收优惠政策减免一定的增值税税款。 此外，小规模纳税人还可以通过减少记账工作量和减少税收申报繁琐程序，从而更轻松地完成税收申报。例如可以不用把每月开具的发票都记录在账簿中，只需统计本月的销售额，在申报表上填入即可。此外，小规模纳税人可以申请所得税优惠，如按月申报，不需要提交年度所得税申报，从而节省申报时间。 通过以上政策和措施，小规模纳税人开普票100多万，增值税申报时免税，可以减少纳税人的申报和缴纳负担，提高小规模纳税人申报增值税和所得税的便利性，节约纳税人的成本，促进经济健康发展。