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是的，按照中国税收法律规定，当一个企业收到的专用发票的税率低于13%时，也可以抵扣增值税。那么，收到3%的专用发票也可以抵扣增值税。具体的抵扣方式一般是按照13%的税率办理专用发票，然后在发票上归集3%专用发票，再依据《征收管理办法》及财税总局函令，按照相应的办法办理抵扣，进行抵扣税款。 除此之外，还有一种称为“发票差额法”的抵扣方式，即企业可先从税务机关申请13%的正常发票，然后到购货单位申请3%的专用发票，将正常发票与专用发票进行结算，最终将剩余的正常发票及专用发票抵扣增值税。 另外，企业使用专用发票抵扣增值税时，要按照发票的经营范围、形式及用途，进行真实、准确的登记，否则，企业使用专用发票抵扣增值税可能会因增值税报税主体不符而被拒绝抵扣。