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首先，根据中国的税收法律，企业在季度预缴税款时，不能将前两年的亏损用在季度预缴税款中，所以，季度预缴时，企业仍然需要按照正常的税收计算进行预缴税款。当汇算清缴时，如果企业在前两年有亏损，可以申请税务机关减免税款，税务机关会根据企业提交的材料综合审核，最终裁定是否可以减免税款。企业还可以通过税收税收公积金或专项抵扣等方式，减少税收。此外，企业还可以在汇算清缴时，利用损益累计金额中的损失，将损失金额转入本年度收入，从而抵消本年度的收入，减少本年度的纳税额。另外，企业也可以在季度预缴税款时，根据前两年亏损情况，利用本期纳税调整的跨期预缴方式，进行跨期预缴，即当期的税金预缴金额可以减少，并可以将部分跨期抵扣权取消，减免税款。