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跨区域缴税后，可以回公司抵扣的税种有：增值税、企业所得税、个人所得税、印花税、土地增值税和营业税等。其中，增值税抵扣方式主要有两种，一种是抵扣方法，即凭抵扣发票，公司在当期销售收入及其他应项税额中减去抵扣税额；另一种是转型抵扣，即进项税额可以直接抵扣销项税额，以减少应付税款额。企业所得税抵扣方式主要有：结构调整抵扣、融资抵扣、技术推广费抵扣、弥补亏损抵扣等；个人所得税抵扣主要有：住房贷款抵扣、住房租金抵扣、子女教育抵扣、大病医疗抵扣、意外伤害抵扣等；印花税抵扣主要有企业抵扣和个人抵扣；土地增值税抵扣只能实施抵扣方式；营业税抵扣只能实施抵扣方式。 拓展知识：对于纳税人而言，在付税手续上，可以采取跨区域缴税或代征税收，跨区域缴税是指税务机关按照法律、法规和规章，在本税务机关管辖的范围内，将所征税收缴纳到其他税务机关管辖的范围内。而代征税收是指一个税务机关按照法律、法规和规章，将自己管辖的税收代征到另一个税务机关管辖的范围内。通过跨区域缴税和代征税收的机制，可以使企业纳税规范化，缩短税收处理时间，提高税收征收效率，降低企业税收负担和融资成本，进一步促进经济社会发展。