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一般来说，由甲企业缴纳城镇土地使用税。因为城镇土地使用税是用地单位或者使用单位根据土地所有者的收益额所征收的，而作为甲企业的土地所有者，它承担着城镇土地使用税的缴纳责任。 我们还可以从另一个角度来看，甲企业通过出租土地获得收益，而收益是直接来源于乙企业的，而乙企业实际上只是用地，而不是拥有土地，所以最后的城镇土地使用税的责任应该由甲企业来承担。 以上就是城镇土地使用税的缴纳情况，由甲企业缴纳，而不是乙企业。 拓展知识：土地税体系的主要税种是土地增值税，城镇土地使用税和房地产税。土地增值税是指土地所有者以土地产生的增值为预征依据，按一定比例征收的税，土地增值税是一种跨时间的税种，它征收的是土地价值的增值部分，而不是固定的一次性征税。