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申请增量留抵退税的方法主要有两种：一是购买进口设备时，可以通过申请即时退税的方式，直接将增量留抵的税收返还给公司，但是这种方式对于逐步从海外进口大宗物资的公司来说，较难实施。第二种方式是申请季审退税的方式，即季度结账审核后，申请增量留抵退税，行政税务机关会根据实际上期税收减收额会及时到帐，但这种方式需要遵守相关法律法规，并且需要准备充分的文件资料。 拓展知识：抵退税是指企业或个人申请，从行政税务机关抵销、退还其应缴的税款的一种纳税行为，主要是指进口企业通过海关申请退还进口产品实际关税税款，也可以指国内企业抵扣税收。抵退税计算公式：抵退税法定额=实际税金-（本月实际工资+上月实际工资）×税率