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小微企业在100万到三百万之间的企业所得税缴纳的比例是5%。首先，该企业在小规模纳税人范围内，应缴纳个人所得税，即“小微企业所得税增值税综合改革试点项目”，以及它们从事生产经营活动得到的增值税。小微企业在100万到三百万之间，缴纳的企业所得税税率为5%。因此，小微企业在100万到三百万之间缴纳的企业所得税比例是5%。 在进行企业所得税缴纳时，企业应当按照国家规定的税率进行缴纳，在计算应缴纳税款时，还需要减去一定的税费减免数额。比如，小微企业可以减免税收应税费用，比如原材料、原料加工费、是和低值易耗品等，经国家明确批准的其他应税费用也可以减免税款。另外，小微企业还可以享受一些国家税收优惠政策，比如减税或抵免税等。 综上所述，小微企业在100万到三百万之间按5%的比例缴纳企业所得税，在计算应缴税款时要减去相应的税费减免额，并享受政府的税收优惠政策来降低企业的税收支出。