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增值税专用发票的税率算法首先要根据不含税运输费用来确定税率，从而确定应纳税额。根据当前税收标准，增值税税率可分为17%和6%两种，其中17%税率适用于大部分服务，6%税率适用于物流、运输等服务，即如果客户向货运公司支付的不含税运输费用为600元，则应纳税额为36元（600*6%），而不是600*17%=102元。一般而言，运输企业发票的税率一般都是6%，并且除这些特定的收费外，其他的收费一般都纳入17%的税率算法。 拓展知识：增值税发票是指由增值税纳税人开具，反映供应商提供服务或者出售商品的金额、税额及相关信息的发票，而增值税专用发票则是一种具有保密性、可更换性、可查验性等特点的依法收发发票，采用单张发票页面显示，及一本专著发票本，形成有效防伪、减少漏票的效果。