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如果购进时开具的专用发票的第二联抵扣联丢失，可以尝试通过下列方式补救： 1.相关方可向税务登记机关办理补开专用发票申请，申请内容需涵盖缴税期间、发票种类、发票代码、发票号码、开具时间、开票内容、购方企业名称、有无抵扣申请等内容，同时，需提供发票保存的复印件及购方增值税一般纳税人资格认定申报表附件等证明材料。 2.可向购方出具收货证明及销货确认函，提示购方请求财政部门出具相关税收抵扣证明； 3.出具提供给有关税务机关的自行开具的发票替代联，该开票内容需与原发票内容相同，并附上发票交易的保证函； 4.出具复印件以及购货方的购货证明文件，通过这些文件，可以向税务机关申请抵扣，但需要对有关文件的真实性进行声明。 拓展知识： 专用发票是税务机关根据国家税收法律法规规定，在指定的税种、指定的税目上所开具的发票，主要用于核销相关税额，具有强制性和纳税凭证功能。另外，有些企业需要办理税收费用时需要提供专用发票，因此专用发票也可以作为支付凭证。