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农产品收购发票在按照有关税收管理规定应当在收购后三个月内计算抵扣。根据《中华人民共和国企业所得税法》第四十六条第二款规定：“主要经营业务收入中收购的农产品，可以在收购后三个月内按照规定发票计算抵扣”。因此，农产品收购发票应当在收购后三个月内计算抵扣，这也正是国家对农业企业的税收优惠政策的体现。 拓展知识：除了农产品收购发票的抵扣，还有其他类型的发票抵扣，例如纸张废旧物资发票和购买仪器设备发票等。根据企业所得税法，企业可以将这些发票用于减免企业所得税，从而减少企业的税收负担。