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该公司在收购玉米时开具了农产品收购发票，上面注明的农产品买价为1000元，根据《中华人民共和国税收法》第十六章的规定，购买农产品的进项税额可以通过买方向销方开具的发票计算，其计算方式为：存货金额×税率=进项税额。因此，该公司收购玉米时所产生的进项税额为1000元×9%=90元。 拓展知识：农产品收购发票是指向农民收购农产品，销售方发给买方的发票，是买方确认收货并交款以及销售方交付发票的有效凭证。此外，农产品收购发票也是买方确认收货以及交税情况的重要证据。