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苗木种植的开票不能作为进项票抵扣，是因为根据《国家税收征管法》的规定，只有增值税纳税人凭发票等支付的货物及加工修理修配劳务等有形动产，其相应的进项税额可以抵扣销项税额，而苗木种植的开票不属于有形动产，因此不能作为进项票抵扣。 此外，就目前国家的规定而言，种植、养殖业者生产的有形动产及加工、修理修配劳务均不可以免税。这也就是为什么苗木种植开票不能作为进项票抵扣的原因。 拓展知识：针对苗木种植行业，建议企业可以采取“开票后实物验收”的方式，由购买方进行实物确认，以此来规范出入口业务，减少税务违法风险。