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通用机打电子发票与增值税普通电子发票主要有以下几个区别： 1、发票种类不同：通用机打电子发票是普通发票的电子版，是普通发票的纸质版的替代品；而增值税普通电子发票是根据国家税务部门的规定发出的一种新的电子发票，属于电子政务的一部分。 2、两种发票的管理方式不同：通用机打电子发票是在发票主体自行管理的，不受国家税务部门监管，具有非常大的开具灵活性；而增值税普通电子发票是受国家税务部门监管，税务部门实行分支机构准许，纳税人有责任保存归档，增加了发票的记录以及对发票的控制的管理。 3、发票唯一性不同： 通用机打发票是由纳税人发放的，存在发票号码重复的问题，可以被人篡改，容易发生税收漏洞；而增值税普通电子发票是由国家税务部门发放的，发票号码唯一，无法被篡改，税收完整性可以得到有效地保障。 由于增值税普通电子发票具有发票唯一性，可以有效地防止发票被篡改，因此有的公司不接受通用机打发票，而要求使用增值税普通电子发票的原因是确保自身财务的系统性，方便和安全地记录财务状况，以及更好地完成和政府有关部门的对账。 拓展知识：增值税普通电子发票与纸质发票相比，更加环保，在复印、移交、存档等环节，避免了大量的纸张消耗和发票浪费，可以实现发票的便捷管理及快捷出入，使发票的开具、查验、作废等程序更加规范、高效。