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北方科技有限公司为一般纳税人，上月取得增值税专用发票，购进辅助材料100万，相关进项税额享有抵扣权，但由于管理不善导致原发票损毁，不得不转出进项税额并做出会计处理。首先，应当做出两笔会计分录，一笔是记入进项税额的转出成本，一笔是记入进项税额的贷方，此外，原发票损毁后，应当立即向税务机关申请补开发票，同时保存相关的购货凭证，以便分期进行抵扣。转出的进项税额也应当向税务机关报送，并须保留相关凭证，以备调查核实。拓展知识：企业在转出进项税额时，应当按规定准备相关凭证，包括发票丢失凭证、补开发票凭证等，以备税务机关核实。