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如果用16238.53元开苗木发票抵税，即需要开具发票金额等于16238.53元的增值税专用发票，此发票的具体金额将由税务机关根据实际缴纳金额和相关税率计算而定，也就是说在开票之前需要了解实际应纳的税费，根据比例算出应纳税额，使发票的金额与实际纳税相符。拓展知识：苗木发票是指专供植物科技、植物科技服务等行业所使用的发票，为了落实“两票制”抵扣，必须具备以下特点：一是发票必须是有效的增值税发票；二是必须有“植物科技”字样；三是必须有“植物科技师”字样或者“植物科技交易”字样。