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是否合理需要从法律的角度来看，考虑母公司和子公司之间的具体关系，进而考虑付款和发票合规性。母公司作为企业法人，对外具有法律行为能力，有权代表公司与外部签订协议，但不能开具发票；而子公司同为企业法人，可以开具发票，可以签订协议，但是受到母公司控股比例限制，其签订的协议必须经过母公司授权方可生效。因此，假设母公司和子公司之间已经存在付款清偿的行为关系，对方付款给子公司，发票从子公司开具，完全符合法律要求，相应的，拓展知识可以是，在企业法人关系中，母公司对子公司需要进行单独签订协议进行确权，以保证双方的权利均受法律保护。