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当出口企业报关单中有一些商品可以申请退税和一些商品可以申请免税时，企业首先需要根据申报税则和海关有关规定对物品的报关类别和税率进行确定，以便明确是否可以申请退税或免税。其次，根据实际情况，准备报关所需要的相关文件，提交给海关进行审核，经查验后审核通过后，海关将发出相应的免税或退税凭证。最后，出口企业根据发放的免税或退税凭证，将对应的退税金额缴纳到海关账户中，或者办理相应的免税手续。 拓展知识： 免税和退税是政府为了减轻企业税务负担而提供的一种税收政策措施，其中免税是指企业的税收减免，而退税是指在扣缴完税款之后，由有关税务机关根据一定条件及时将已扣缴的税款退还到企业账户中。