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在总包合同按料、工分别开票的情况下，一般都是按照合同约定的料、工两项分别开票。料的发票将其中的材料进行分类计价，发票金额将由专业人员进行验收后确定；工的发票则可以按照进行工程项目的人员费用，也可以按照施工单位自报工程进度及报销相应的费用进行索取，发票金额也是经过验收后确定。 假如采取按9开工程款的方式，也就是把材料和劳务分开开票，材料发票金额依据合同验收确定，劳务发票则由与施工单位签订的劳务合同内规定的数额（报酬）来索取。一般的9开的发票由施工单位行为主体报销，而不是由总包单位进行直接报销，所以当项目完工后，施工单位在准备结算时，需要与总包单位核对发票金额对等，并将发票交由总包单位报销。 从上述可见，在选择总包合同的按料、工分别开票或者按9开工程款的方式时，我们需要根据项目具体情况来确定最合理的开票方式，以更好地保障权益。除此之外，我们还应该注意合同的规定，防止违反合同而招致纠纷。