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电子发票作废一般通过税控系统或者收费软件进行操作，操作步骤如下： 1.登录税控系统或收费软件，进入“开票”栏目，选择“作废”功能； 2.输入原发票号码，点击“确定”； 3.校验发票是否正确，如果正确会有“此发票符合作废条件”的提示，点击“确定”； 4.输入作废原因，点击“确定”； 5.系统会自动生成作废凭据（其中包括作废后的新发票号码）。 无论是税控系统还是收费软件，作废发票都必须在收到发票当日就完成作废，并保证发票应纳税额不发生变化。 另外，税控系统在发票作废后，会自动把发票信息发送到税务机关，以便于税务机关排查财务异常。 拓展知识： 发票作废不同于发票红冲，发票红冲是重新开具新的发票，用来代替原发票的发票，新发票的税额与原发票的税额完全一致；而发票作废是把原发票号码作废，税额和收入金额不会发生变化。