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农民专业合作社免税，21年有利润5万，无票成本支出1万，所得税汇算清缴时，应当按照有关税收法规确定企业所得税税率，按照应纳额计算应纳税额并缴纳至国家税务机关。 首先要计算的是税后净利润，根据农民专业合作社的免税政策，其税后净利润应当按照全部利润减去实际支出的方式进行计算，即：税后净利润=50000-10000=40000；接下来根据《中华人民共和国企业所得税法》规定，农民专业合作社年度应纳税所得额在30000元（含30000元）以下的，按照税率20%计税，税额为40000*20%=8000元。所以，该企业应按照上述方式算出的应纳税额8000元应缴至国家税务机关。 拓展知识：所得税是国家有关部门对企业和个人征收的一种税种，是企业经营活动中非物质收入的税收，其目的是控制企业收入，并使企业和个人能够共同为社会贡献资金。