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公司变更股东个税和印花税计税依据也有所不同，个税变更股东计税依据是按股权转让时股东股权投资额实际取得的投资收益，该投资收益应按月分灰按60％计征个人所得税。印花税变更股东计税依据是以股权转让时变更股东股权投资额为基数，按照本国税率标准比例计征印花税。 关于税率，个人所得税税率从3%起征，最高可达45%，印花税税率为0.1%，但也有一些地方规定比0.1%更高的税率。 拓展知识：变更股东变更后还需要申报税务，变更股东需要向税务机关申报企业所得税、个人所得税和印花税。企业所得税、个人所得税的税率和纳税相关规定应按照关税法及相关规定执行，税款应及时申报、缴纳。