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首先，根据当前法律法规，为了保证员工的正当经济待遇，子公司应当妥善管理工资和福利，并将工资发放清晰记录。在账务处理方面可以采用两种方法： 1、有薪劳务外包：子公司以薪资发放到总公司并签订劳务外包协议，由总公司支付给员工工资，并可以把子公司的费用扣除支出； 2、记付费方式：子公司把绩效奖励支付给总公司，由总公司直接记入个人账户。 此外，还需要做好账务核算，录入相关账目，保证财务支出的正确性和完整性。同时，为了保证财务分析的准确性，应当制定完善的财务会计及管理制度，以提高企业的会计管理水平。