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企业向员工个人借款发放利息发票的开具流程如下： 1、企业先联系税务机关，将个人借款和其他相关信息报送给税务机关，由税务机关核定和确认企业从事的是否属于贷款和发放利息； 2、借款时，企业应出具贷款合同，贷款余额应当以现金形式给予借款人； 3、企业应当按照贷款合同规定的每期期息计息，按每期贷款余额确定利息，并将该期利息与当期本金相加作为下期贷款金额支付给借款人； 4、企业需要与借款人签订利息发票，在发票上注明“发放利息”的纳税义务，发票应当按照国家发票规定严格开具； 5、借款人收到发票后，应当妥善保管，计算税后收益，减免所得税； 6、企业应当按照国家有关规定，准确缴纳个人借款利息发放税款。