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对于自查补缴增值税，账务处理应包括以下几个步骤： 一、根据纳税人的补缴申请书、税务机关出具的最终决定书、相关发票等税务凭证，在财务系统中增加补缴增值税科目； 二、在收到税务机关出具的最终决定书时，在财务系统中录入各项费用，包括自查补缴税款、申报金额、差额补缴、利息等； 三、应按照“税款缴纳日期”与“收取税务机关最终决定书日期”，将补缴增值税科目金额划分为清算金额与未清算金额； 四、缴纳补缴增值税后，在财务系统里分别登记补缴增值税收入科目和财政补贴科目，并根据税务机关出具的税务发票进行抵扣； 五、根据最终决定书及其他财务凭证，登记自查补缴增值税科目的支出及相关费用； 六、将自查补缴增值税及相关费用的收入和支出的凭证进行完整的结算，以确保账务处理准确无误。