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根据《中华人民共和国企业所得税法》的相关规定，分公司注销的税款是可以税前扣除的。比如，如果一家集团公司有4家子公司，其中一家子公司申请注销的时候，集团公司在集团公司的企业所得税申报表中可以税前减免因注销产生的企业所得税。只要提供足够的证据来证明注销产生的税款是真实存在的，并确认税款已经由总公司支付，这些税款就可以税前扣除。