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根据《中华人民共和国会计法》第二十五条的规定，苗木的普票计算抵扣应当按照以下步骤进行： 1.在申报表上记录普票的发票号，发票类型，普票的供应商，金额等信息。 2.计算出苗木的普票金额总和，并在申报表上明确填写。 3. 在“应纳税额”栏中，减去普票金额总和，得出应纳税额减免的数额。 4.将减免的数额添加到该申报表的“纳税减免”栏中，并按照税务部门的规定办理结账手续。 案例：假设A公司在某期间有7张普票，总金额为3500元，此时应纳税额为30000元，则A公司需要在申报表上记录7张普票的发票号，发票类型，供应商等信息，并将普票总金额填写到表格中，从应纳税额中减去普票总金额，即减免3500元，然后将该项减免数额填写到“纳税减免”中，最后按照税务部门的规定办理结账手续。